上海科技大学从2014年开始招收首届本科生。2018年,首届184名本科生毕业并授予上海科技大学学士学位。截止2020年9月,已有三届782名本科生毕业并授予上海科技大学学士学位。
2013-2016年,上海科技大学依托中国科学院大学联合招收和培养硕博连读和硕士研究生。2017年开始,上海科技大学以硕博连读的方式独立招收培养硕士和博士研究生。截止2020年9月,已连续招收八届共计4087名研究生(含联培研究生),其中六届1110名已转博(含联培研究生),五届共计718名联培研究生已依托国科大毕业并获得硕士学位,三届239名联培研究生已依托国科大毕业并获得博士学位,首届83名硕士研究生、15名博士研究生毕业并授予上海科技大学学位。